Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nectin3Q9JLB9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nectin3Q9JLB9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nectin3Q9JLB9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms