Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtsmQ9JL96 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtsmQ9JL96 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtsmQ9JL96 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtsmQ9JL96 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CtsmQ9JL96 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CtsmQ9JL96 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtsmQ9JL96 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtsmQ9JL96 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtsmQ9JL96 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtsmQ9JL96 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtsmQ9JL96 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtsmQ9JL96 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtsmQ9JL96 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtsmQ9JL96 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsmQ9JL96 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsmQ9JL96 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsmQ9JL96 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtsmQ9JL96 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsmQ9JL96 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsmQ9JL96 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsmQ9JL96 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsmQ9JL96 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsmQ9JL96 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsmQ9JL96 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsmQ9JL96 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsmQ9JL96 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsmQ9JL96 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtsmQ9JL96 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsmQ9JL96 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsmQ9JL96 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsmQ9JL96 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsmQ9JL96 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CtsmQ9JL96 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CtsmQ9JL96 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms