Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL16

Isg20, Interferon-stimulated gene 20 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isg20Q9JL16 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Isg20Q9JL16 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Isg20Q9JL16 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Isg20Q9JL16 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Isg20Q9JL16 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Isg20Q9JL16 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Isg20Q9JL16 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Isg20Q9JL16 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Isg20Q9JL16 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Isg20Q9JL16 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Isg20Q9JL16 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Isg20Q9JL16 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Isg20Q9JL16 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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