Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gpa33Q9JKA5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpa33Q9JKA5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms