Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpd3Q9JJY3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smpd3Q9JJY3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smpd3Q9JJY3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms