Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC6

Rilpl1, RILP-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rilpl1Q9JJC6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rilpl1Q9JJC6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rilpl1Q9JJC6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rilpl1Q9JJC6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rilpl1Q9JJC6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rilpl1Q9JJC6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rilpl1Q9JJC6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rilpl1Q9JJC6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rilpl1Q9JJC6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rilpl1Q9JJC6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rilpl1Q9JJC6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rilpl1Q9JJC6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rilpl1Q9JJC6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rilpl1Q9JJC6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rilpl1Q9JJC6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rilpl1Q9JJC6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rilpl1Q9JJC6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rilpl1Q9JJC6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rilpl1Q9JJC6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rilpl1Q9JJC6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rilpl1Q9JJC6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rilpl1Q9JJC6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rilpl1Q9JJC6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rilpl1Q9JJC6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rilpl1Q9JJC6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rilpl1Q9JJC6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rilpl1Q9JJC6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rilpl1Q9JJC6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rilpl1Q9JJC6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rilpl1Q9JJC6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rilpl1Q9JJC6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms