Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ0

Cml1, Probable N-acetyltransferase CML1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml1Q9JIZ0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cml1Q9JIZ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cml1Q9JIZ0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cml1Q9JIZ0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cml1Q9JIZ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cml1Q9JIZ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cml1Q9JIZ0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cml1Q9JIZ0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cml1Q9JIZ0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cml1Q9JIZ0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cml1Q9JIZ0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cml1Q9JIZ0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cml1Q9JIZ0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cml1Q9JIZ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cml1Q9JIZ0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cml1Q9JIZ0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cml1Q9JIZ0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cml1Q9JIZ0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cml1Q9JIZ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cml1Q9JIZ0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms