Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM1

Slc29a1, Equilibrative nucleoside transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc29a1Q9JIM1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc29a1Q9JIM1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc29a1Q9JIM1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc29a1Q9JIM1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc29a1Q9JIM1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc29a1Q9JIM1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc29a1Q9JIM1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc29a1Q9JIM1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc29a1Q9JIM1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc29a1Q9JIM1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc29a1Q9JIM1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc29a1Q9JIM1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc29a1Q9JIM1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc29a1Q9JIM1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc29a1Q9JIM1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc29a1Q9JIM1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc29a1Q9JIM1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc29a1Q9JIM1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc29a1Q9JIM1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc29a1Q9JIM1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc29a1Q9JIM1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc29a1Q9JIM1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc29a1Q9JIM1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc29a1Q9JIM1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc29a1Q9JIM1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc29a1Q9JIM1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc29a1Q9JIM1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc29a1Q9JIM1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc29a1Q9JIM1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc29a1Q9JIM1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc29a1Q9JIM1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc29a1Q9JIM1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc29a1Q9JIM1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc29a1Q9JIM1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc29a1Q9JIM1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc29a1Q9JIM1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc29a1Q9JIM1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc29a1Q9JIM1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc29a1Q9JIM1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc29a1Q9JIM1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms