Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccl28Q9JIL2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl28Q9JIL2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl28Q9JIL2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms