Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI0

Mmp19, Matrix metalloproteinase-19, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp19Q9JHI0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp19Q9JHI0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Mmp19Q9JHI0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mmp19Q9JHI0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mmp19Q9JHI0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp19Q9JHI0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp19Q9JHI0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp19Q9JHI0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp19Q9JHI0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp19Q9JHI0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp19Q9JHI0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp19Q9JHI0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp19Q9JHI0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp19Q9JHI0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp19Q9JHI0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp19Q9JHI0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp19Q9JHI0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mmp19Q9JHI0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp19Q9JHI0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp19Q9JHI0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp19Q9JHI0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp19Q9JHI0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp19Q9JHI0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms