Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zcchc17Q9ESX4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zcchc17Q9ESX4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zcchc17Q9ESX4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zcchc17Q9ESX4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zcchc17Q9ESX4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zcchc17Q9ESX4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zcchc17Q9ESX4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zcchc17Q9ESX4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zcchc17Q9ESX4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zcchc17Q9ESX4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zcchc17Q9ESX4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zcchc17Q9ESX4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zcchc17Q9ESX4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zcchc17Q9ESX4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zcchc17Q9ESX4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zcchc17Q9ESX4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Zcchc17Q9ESX4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zcchc17Q9ESX4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zcchc17Q9ESX4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms