Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES30

C1qtnf3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf3Q9ES30 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
C1qtnf3Q9ES30 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
C1qtnf3Q9ES30 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
C1qtnf3Q9ES30 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
C1qtnf3Q9ES30 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
C1qtnf3Q9ES30 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
C1qtnf3Q9ES30 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
C1qtnf3Q9ES30 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,58■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22,54■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22,54■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22,52■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
C1qtnf3Q9ES30 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22,51■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22,49■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,49■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,49■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22,47■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22,47■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22,47■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,45■■□□□ 1,19
C1qtnf3Q9ES30 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22,45■■□□□ 1,18
C1qtnf3Q9ES30 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
C1qtnf3Q9ES30 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
C1qtnf3Q9ES30 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
C1qtnf3Q9ES30 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
C1qtnf3Q9ES30 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
C1qtnf3Q9ES30 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22,41■■□□□ 1,18
C1qtnf3Q9ES30 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
C1qtnf3Q9ES30 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,4■■□□□ 1,18
C1qtnf3Q9ES30 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
C1qtnf3Q9ES30 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
C1qtnf3Q9ES30 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
C1qtnf3Q9ES30 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
C1qtnf3Q9ES30 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22,39■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22,39■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,38■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22,36■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22,36■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22,35■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22,35■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22,35■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22,33■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22,33■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
C1qtnf3Q9ES30 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22,33■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,31■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22,31■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22,3■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
C1qtnf3Q9ES30 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms