Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp13a1Q9EPE9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp13a1Q9EPE9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp13a1Q9EPE9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp13a1Q9EPE9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp13a1Q9EPE9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp13a1Q9EPE9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp13a1Q9EPE9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp13a1Q9EPE9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp13a1Q9EPE9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp13a1Q9EPE9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp13a1Q9EPE9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp13a1Q9EPE9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp13a1Q9EPE9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp13a1Q9EPE9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp13a1Q9EPE9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp13a1Q9EPE9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp13a1Q9EPE9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp13a1Q9EPE9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp13a1Q9EPE9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp13a1Q9EPE9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp13a1Q9EPE9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp13a1Q9EPE9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp13a1Q9EPE9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp13a1Q9EPE9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp13a1Q9EPE9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp13a1Q9EPE9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp13a1Q9EPE9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp13a1Q9EPE9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp13a1Q9EPE9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp13a1Q9EPE9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp13a1Q9EPE9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp13a1Q9EPE9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms