Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCX2

Atp5h, ATP synthase subunit d, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5hQ9DCX2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp5hQ9DCX2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp5hQ9DCX2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp5hQ9DCX2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp5hQ9DCX2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp5hQ9DCX2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp5hQ9DCX2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp5hQ9DCX2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp5hQ9DCX2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp5hQ9DCX2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp5hQ9DCX2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp5hQ9DCX2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp5hQ9DCX2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp5hQ9DCX2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp5hQ9DCX2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp5hQ9DCX2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp5hQ9DCX2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp5hQ9DCX2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms