Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpne8Q9DC53 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne8Q9DC53 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpne8Q9DC53 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpne8Q9DC53 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpne8Q9DC53 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpne8Q9DC53 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpne8Q9DC53 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpne8Q9DC53 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpne8Q9DC53 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpne8Q9DC53 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpne8Q9DC53 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpne8Q9DC53 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpne8Q9DC53 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpne8Q9DC53 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpne8Q9DC53 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpne8Q9DC53 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpne8Q9DC53 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms