Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBX3

Susd2, Sushi domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd2Q9DBX3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd2Q9DBX3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd2Q9DBX3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd2Q9DBX3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd2Q9DBX3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd2Q9DBX3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd2Q9DBX3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd2Q9DBX3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd2Q9DBX3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Susd2Q9DBX3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Susd2Q9DBX3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd2Q9DBX3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Susd2Q9DBX3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd2Q9DBX3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd2Q9DBX3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd2Q9DBX3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd2Q9DBX3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd2Q9DBX3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd2Q9DBX3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd2Q9DBX3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd2Q9DBX3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Susd2Q9DBX3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd2Q9DBX3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd2Q9DBX3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Susd2Q9DBX3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd2Q9DBX3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd2Q9DBX3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd2Q9DBX3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd2Q9DBX3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms