Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcg8Q9DBM0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcg8Q9DBM0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcg8Q9DBM0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcg8Q9DBM0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcg8Q9DBM0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcg8Q9DBM0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcg8Q9DBM0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcg8Q9DBM0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcg8Q9DBM0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcg8Q9DBM0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcg8Q9DBM0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcg8Q9DBM0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcg8Q9DBM0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcg8Q9DBM0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcg8Q9DBM0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcg8Q9DBM0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcg8Q9DBM0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcg8Q9DBM0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcg8Q9DBM0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcg8Q9DBM0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Abcg8Q9DBM0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcg8Q9DBM0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcg8Q9DBM0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcg8Q9DBM0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcg8Q9DBM0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcg8Q9DBM0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcg8Q9DBM0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcg8Q9DBM0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcg8Q9DBM0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcg8Q9DBM0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcg8Q9DBM0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcg8Q9DBM0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcg8Q9DBM0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms