Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr53Q9DB94 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr53Q9DB94 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr53Q9DB94 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr53Q9DB94 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr53Q9DB94 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr53Q9DB94 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr53Q9DB94 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr53Q9DB94 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr53Q9DB94 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr53Q9DB94 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr53Q9DB94 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr53Q9DB94 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr53Q9DB94 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr53Q9DB94 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr53Q9DB94 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr53Q9DB94 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr53Q9DB94 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Wdr53Q9DB94 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr53Q9DB94 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr53Q9DB94 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms