Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp2aQ9DB34 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp2aQ9DB34 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp2aQ9DB34 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp2aQ9DB34 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp2aQ9DB34 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp2aQ9DB34 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp2aQ9DB34 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp2aQ9DB34 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp2aQ9DB34 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp2aQ9DB34 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp2aQ9DB34 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp2aQ9DB34 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp2aQ9DB34 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp2aQ9DB34 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp2aQ9DB34 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp2aQ9DB34 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp2aQ9DB34 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp2aQ9DB34 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp2aQ9DB34 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp2aQ9DB34 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp2aQ9DB34 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp2aQ9DB34 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp2aQ9DB34 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp2aQ9DB34 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp2aQ9DB34 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp2aQ9DB34 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp2aQ9DB34 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms