Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp5oQ9DB20 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp5oQ9DB20 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp5oQ9DB20 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp5oQ9DB20 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp5oQ9DB20 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp5oQ9DB20 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp5oQ9DB20 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp5oQ9DB20 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp5oQ9DB20 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp5oQ9DB20 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp5oQ9DB20 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp5oQ9DB20 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp5oQ9DB20 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp5oQ9DB20 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp5oQ9DB20 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp5oQ9DB20 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp5oQ9DB20 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp5oQ9DB20 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp5oQ9DB20 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp5oQ9DB20 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp5oQ9DB20 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp5oQ9DB20 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp5oQ9DB20 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp5oQ9DB20 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp5oQ9DB20 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp5oQ9DB20 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp5oQ9DB20 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp5oQ9DB20 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp5oQ9DB20 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp5oQ9DB20 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp5oQ9DB20 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp5oQ9DB20 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms