Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAQ7

3110070M22Rik, RIKEN cDNA 3110070M22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110070M22RikQ9DAQ7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
3110070M22RikQ9DAQ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
3110070M22RikQ9DAQ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
3110070M22RikQ9DAQ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms