Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd8Q9DA37 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd8Q9DA37 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samd8Q9DA37 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samd8Q9DA37 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd8Q9DA37 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd8Q9DA37 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd8Q9DA37 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd8Q9DA37 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd8Q9DA37 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd8Q9DA37 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd8Q9DA37 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd8Q9DA37 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd8Q9DA37 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd8Q9DA37 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd8Q9DA37 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd8Q9DA37 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd8Q9DA37 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd8Q9DA37 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd8Q9DA37 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd8Q9DA37 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd8Q9DA37 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd8Q9DA37 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd8Q9DA37 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd8Q9DA37 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd8Q9DA37 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samd8Q9DA37 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samd8Q9DA37 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd8Q9DA37 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd8Q9DA37 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms