Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp12Q9D9M2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp12Q9D9M2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp12Q9D9M2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp12Q9D9M2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp12Q9D9M2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp12Q9D9M2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp12Q9D9M2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp12Q9D9M2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp12Q9D9M2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms