Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc70Q9D9B0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc70Q9D9B0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc70Q9D9B0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc70Q9D9B0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc70Q9D9B0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc70Q9D9B0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc70Q9D9B0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc70Q9D9B0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc70Q9D9B0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc70Q9D9B0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms