Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c6Q9D8P7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c6Q9D8P7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c6Q9D8P7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c6Q9D8P7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c6Q9D8P7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c6Q9D8P7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c6Q9D8P7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c6Q9D8P7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c6Q9D8P7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c6Q9D8P7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c6Q9D8P7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c6Q9D8P7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c6Q9D8P7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c6Q9D8P7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c6Q9D8P7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gtf3c6Q9D8P7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c6Q9D8P7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms