Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C9

Pnp2, Purine nucleoside phosphorylase, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnp2Q9D8C9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnp2Q9D8C9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnp2Q9D8C9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnp2Q9D8C9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnp2Q9D8C9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnp2Q9D8C9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnp2Q9D8C9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnp2Q9D8C9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnp2Q9D8C9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnp2Q9D8C9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnp2Q9D8C9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnp2Q9D8C9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pnp2Q9D8C9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pnp2Q9D8C9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pnp2Q9D8C9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnp2Q9D8C9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnp2Q9D8C9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnp2Q9D8C9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms