Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AplfQ9D842 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AplfQ9D842 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AplfQ9D842 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
AplfQ9D842 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms