Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb4aQ9D6F9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tubb4aQ9D6F9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 306 ms