Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms