Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Speer4f1Q9D5Q6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Speer4f1Q9D5Q6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Speer4f1Q9D5Q6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Speer4f1Q9D5Q6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Speer4f1Q9D5Q6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Speer4f1Q9D5Q6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Speer4f1Q9D5Q6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Speer4f1Q9D5Q6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Speer4f1Q9D5Q6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Speer4f1Q9D5Q6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Speer4f1Q9D5Q6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Speer4f1Q9D5Q6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Speer4f1Q9D5Q6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Speer4f1Q9D5Q6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Speer4f1Q9D5Q6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Speer4f1Q9D5Q6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Speer4f1Q9D5Q6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Speer4f1Q9D5Q6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Speer4f1Q9D5Q6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Speer4f1Q9D5Q6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Speer4f1Q9D5Q6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Speer4f1Q9D5Q6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Speer4f1Q9D5Q6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Speer4f1Q9D5Q6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Speer4f1Q9D5Q6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Speer4f1Q9D5Q6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Speer4f1Q9D5Q6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Speer4f1Q9D5Q6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Speer4f1Q9D5Q6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Speer4f1Q9D5Q6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Speer4f1Q9D5Q6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Speer4f1Q9D5Q6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Speer4f1Q9D5Q6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Speer4f1Q9D5Q6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Speer4f1Q9D5Q6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Speer4f1Q9D5Q6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Speer4f1Q9D5Q6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Speer4f1Q9D5Q6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Speer4f1Q9D5Q6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Speer4f1Q9D5Q6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Speer4f1Q9D5Q6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Speer4f1Q9D5Q6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Speer4f1Q9D5Q6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Speer4f1Q9D5Q6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Speer4f1Q9D5Q6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Speer4f1Q9D5Q6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Speer4f1Q9D5Q6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms