Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5F6

4930447A16Rik, RIKEN cDNA 4930447A16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447A16RikQ9D5F6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930447A16RikQ9D5F6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
4930447A16RikQ9D5F6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930447A16RikQ9D5F6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms