Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf6Q9D4J7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Phf6Q9D4J7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf6Q9D4J7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf6Q9D4J7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf6Q9D4J7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Phf6Q9D4J7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Phf6Q9D4J7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf6Q9D4J7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf6Q9D4J7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf6Q9D4J7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf6Q9D4J7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf6Q9D4J7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf6Q9D4J7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf6Q9D4J7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf6Q9D4J7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf6Q9D4J7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf6Q9D4J7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Phf6Q9D4J7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 402.6 ms