Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam90a1bQ9D4F3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam90a1bQ9D4F3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam90a1bQ9D4F3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam90a1bQ9D4F3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam90a1bQ9D4F3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam90a1bQ9D4F3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam90a1bQ9D4F3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam90a1bQ9D4F3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam90a1bQ9D4F3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam90a1bQ9D4F3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam90a1bQ9D4F3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam90a1bQ9D4F3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam90a1bQ9D4F3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam90a1bQ9D4F3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam90a1bQ9D4F3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam90a1bQ9D4F3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms