Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Efhc2Q9D485 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efhc2Q9D485 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Efhc2Q9D485 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efhc2Q9D485 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efhc2Q9D485 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efhc2Q9D485 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efhc2Q9D485 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efhc2Q9D485 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efhc2Q9D485 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efhc2Q9D485 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Efhc2Q9D485 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efhc2Q9D485 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efhc2Q9D485 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efhc2Q9D485 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efhc2Q9D485 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efhc2Q9D485 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efhc2Q9D485 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efhc2Q9D485 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efhc2Q9D485 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efhc2Q9D485 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efhc2Q9D485 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efhc2Q9D485 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efhc2Q9D485 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efhc2Q9D485 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efhc2Q9D485 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efhc2Q9D485 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efhc2Q9D485 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efhc2Q9D485 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efhc2Q9D485 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Efhc2Q9D485 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efhc2Q9D485 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms