Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtl8bQ9D1F0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtl8bQ9D1F0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtl8bQ9D1F0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtl8bQ9D1F0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtl8bQ9D1F0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtl8bQ9D1F0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtl8bQ9D1F0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtl8bQ9D1F0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtl8bQ9D1F0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtl8bQ9D1F0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtl8bQ9D1F0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtl8bQ9D1F0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtl8bQ9D1F0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl8bQ9D1F0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtl8bQ9D1F0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rtl8bQ9D1F0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtl8bQ9D1F0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtl8bQ9D1F0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtl8bQ9D1F0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtl8bQ9D1F0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtl8bQ9D1F0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtl8bQ9D1F0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtl8bQ9D1F0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtl8bQ9D1F0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtl8bQ9D1F0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtl8bQ9D1F0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms