Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl52Q9D0Y8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl52Q9D0Y8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl52Q9D0Y8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl52Q9D0Y8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl52Q9D0Y8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl52Q9D0Y8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl52Q9D0Y8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl52Q9D0Y8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl52Q9D0Y8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl52Q9D0Y8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl52Q9D0Y8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl52Q9D0Y8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl52Q9D0Y8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms