Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdca7Q9D0M2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdca7Q9D0M2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdca7Q9D0M2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdca7Q9D0M2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdca7Q9D0M2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cdca7Q9D0M2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdca7Q9D0M2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdca7Q9D0M2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdca7Q9D0M2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdca7Q9D0M2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdca7Q9D0M2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdca7Q9D0M2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdca7Q9D0M2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdca7Q9D0M2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdca7Q9D0M2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdca7Q9D0M2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdca7Q9D0M2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdca7Q9D0M2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdca7Q9D0M2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdca7Q9D0M2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdca7Q9D0M2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdca7Q9D0M2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdca7Q9D0M2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdca7Q9D0M2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cdca7Q9D0M2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.7 ms