Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0C4

Trmt5, tRNA (guanine(37)-N1)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt5Q9D0C4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt5Q9D0C4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trmt5Q9D0C4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt5Q9D0C4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt5Q9D0C4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt5Q9D0C4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt5Q9D0C4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt5Q9D0C4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt5Q9D0C4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt5Q9D0C4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trmt5Q9D0C4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt5Q9D0C4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt5Q9D0C4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt5Q9D0C4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trmt5Q9D0C4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt5Q9D0C4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trmt5Q9D0C4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trmt5Q9D0C4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trmt5Q9D0C4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trmt5Q9D0C4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trmt5Q9D0C4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trmt5Q9D0C4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trmt5Q9D0C4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trmt5Q9D0C4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trmt5Q9D0C4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trmt5Q9D0C4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt5Q9D0C4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt5Q9D0C4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt5Q9D0C4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt5Q9D0C4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trmt5Q9D0C4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trmt5Q9D0C4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trmt5Q9D0C4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trmt5Q9D0C4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trmt5Q9D0C4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trmt5Q9D0C4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trmt5Q9D0C4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt5Q9D0C4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms