Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZS3

Fopnl, LisH domain-containing protein FOPNL, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FopnlQ9CZS3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FopnlQ9CZS3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FopnlQ9CZS3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FopnlQ9CZS3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FopnlQ9CZS3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms