Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rrs1Q9CYH6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rrs1Q9CYH6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rrs1Q9CYH6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rrs1Q9CYH6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rrs1Q9CYH6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rrs1Q9CYH6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rrs1Q9CYH6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rrs1Q9CYH6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rrs1Q9CYH6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rrs1Q9CYH6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rrs1Q9CYH6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rrs1Q9CYH6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rrs1Q9CYH6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Rrs1Q9CYH6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rrs1Q9CYH6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rrs1Q9CYH6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rrs1Q9CYH6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rrs1Q9CYH6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rrs1Q9CYH6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rrs1Q9CYH6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rrs1Q9CYH6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rrs1Q9CYH6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rrs1Q9CYH6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rrs1Q9CYH6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rrs1Q9CYH6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rrs1Q9CYH6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rrs1Q9CYH6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rrs1Q9CYH6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrs1Q9CYH6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrs1Q9CYH6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrs1Q9CYH6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrs1Q9CYH6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrs1Q9CYH6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrs1Q9CYH6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrs1Q9CYH6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms