Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm8Q9CXT6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm8Q9CXT6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm8Q9CXT6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm8Q9CXT6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm8Q9CXT6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm8Q9CXT6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm8Q9CXT6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm8Q9CXT6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm8Q9CXT6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm8Q9CXT6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm8Q9CXT6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm8Q9CXT6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Kdm8Q9CXT6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm8Q9CXT6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm8Q9CXT6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm8Q9CXT6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm8Q9CXT6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm8Q9CXT6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm8Q9CXT6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm8Q9CXT6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm8Q9CXT6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm8Q9CXT6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm8Q9CXT6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm8Q9CXT6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm8Q9CXT6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm8Q9CXT6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm8Q9CXT6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm8Q9CXT6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm8Q9CXT6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm8Q9CXT6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm8Q9CXT6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm8Q9CXT6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm8Q9CXT6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm8Q9CXT6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm8Q9CXT6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kdm8Q9CXT6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kdm8Q9CXT6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Kdm8Q9CXT6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Kdm8Q9CXT6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm8Q9CXT6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm8Q9CXT6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm8Q9CXT6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm8Q9CXT6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm8Q9CXT6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm8Q9CXT6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm8Q9CXT6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm8Q9CXT6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm8Q9CXT6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm8Q9CXT6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm8Q9CXT6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm8Q9CXT6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm8Q9CXT6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms