Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Exo5Q9CXP9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Exo5Q9CXP9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Exo5Q9CXP9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Exo5Q9CXP9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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