Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr55Q9CX97 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr55Q9CX97 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr55Q9CX97 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr55Q9CX97 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr55Q9CX97 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr55Q9CX97 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Wdr55Q9CX97 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr55Q9CX97 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Wdr55Q9CX97 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr55Q9CX97 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr55Q9CX97 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr55Q9CX97 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr55Q9CX97 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr55Q9CX97 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr55Q9CX97 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr55Q9CX97 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr55Q9CX97 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr55Q9CX97 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr55Q9CX97 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr55Q9CX97 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr55Q9CX97 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr55Q9CX97 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms