Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snx10Q9CWT3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snx10Q9CWT3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx10Q9CWT3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx10Q9CWT3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx10Q9CWT3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx10Q9CWT3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx10Q9CWT3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx10Q9CWT3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx10Q9CWT3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx10Q9CWT3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx10Q9CWT3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx10Q9CWT3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx10Q9CWT3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx10Q9CWT3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx10Q9CWT3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx10Q9CWT3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx10Q9CWT3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx10Q9CWT3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx10Q9CWT3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx10Q9CWT3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx10Q9CWT3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx10Q9CWT3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx10Q9CWT3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx10Q9CWT3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx10Q9CWT3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx10Q9CWT3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx10Q9CWT3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx10Q9CWT3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx10Q9CWT3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx10Q9CWT3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx10Q9CWT3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx10Q9CWT3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx10Q9CWT3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx10Q9CWT3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx10Q9CWT3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx10Q9CWT3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx10Q9CWT3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx10Q9CWT3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx10Q9CWT3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx10Q9CWT3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx10Q9CWT3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx10Q9CWT3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms