Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NubplQ9CWD8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NubplQ9CWD8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NubplQ9CWD8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NubplQ9CWD8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NubplQ9CWD8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms