Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rhobtb3Q9CTN4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rhobtb3Q9CTN4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rhobtb3Q9CTN4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rhobtb3Q9CTN4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rhobtb3Q9CTN4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rhobtb3Q9CTN4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rhobtb3Q9CTN4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rhobtb3Q9CTN4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rhobtb3Q9CTN4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rhobtb3Q9CTN4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rhobtb3Q9CTN4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rhobtb3Q9CTN4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rhobtb3Q9CTN4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rhobtb3Q9CTN4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rhobtb3Q9CTN4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rhobtb3Q9CTN4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rhobtb3Q9CTN4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rhobtb3Q9CTN4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rhobtb3Q9CTN4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rhobtb3Q9CTN4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rhobtb3Q9CTN4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rhobtb3Q9CTN4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rhobtb3Q9CTN4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rhobtb3Q9CTN4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rhobtb3Q9CTN4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rhobtb3Q9CTN4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rhobtb3Q9CTN4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhobtb3Q9CTN4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhobtb3Q9CTN4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhobtb3Q9CTN4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rhobtb3Q9CTN4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhobtb3Q9CTN4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhobtb3Q9CTN4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhobtb3Q9CTN4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rhobtb3Q9CTN4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rhobtb3Q9CTN4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rhobtb3Q9CTN4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms