Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRG1

Tm7sf3, Transmembrane 7 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm7sf3Q9CRG1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tm7sf3Q9CRG1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tm7sf3Q9CRG1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tm7sf3Q9CRG1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tm7sf3Q9CRG1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tm7sf3Q9CRG1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm7sf3Q9CRG1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tm7sf3Q9CRG1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tm7sf3Q9CRG1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms