Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc96Q9CR92 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc96Q9CR92 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc96Q9CR92 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc96Q9CR92 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc96Q9CR92 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc96Q9CR92 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc96Q9CR92 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc96Q9CR92 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc96Q9CR92 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc96Q9CR92 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc96Q9CR92 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc96Q9CR92 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc96Q9CR92 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc96Q9CR92 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc96Q9CR92 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc96Q9CR92 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc96Q9CR92 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc96Q9CR92 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc96Q9CR92 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc96Q9CR92 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc96Q9CR92 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc96Q9CR92 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc96Q9CR92 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc96Q9CR92 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc96Q9CR92 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc96Q9CR92 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc96Q9CR92 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc96Q9CR92 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc96Q9CR92 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc96Q9CR92 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc96Q9CR92 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc96Q9CR92 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc96Q9CR92 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms