Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccer1Q9CQL2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccer1Q9CQL2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccer1Q9CQL2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccer1Q9CQL2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccer1Q9CQL2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms