Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DenrQ9CQJ6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DenrQ9CQJ6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DenrQ9CQJ6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms